Category: животные

Category was added automatically. Read all entries about "животные".

Паук С.В.

Интервью Владимира Воеводского (часть 2)

Оригинал взят у baaltii1 в Интервью Владимира Воеводского (часть 2)

Это продолжение интервью Владимира Воеводского. Первая часть была воспринята читателями с интересом. Мы благодарим за содержательные вопросы и продолжаем.



- Мне трудно представить, что происходит внутри человека атеистических взглядов, когда перед ним раскрываются необычные для него слои реальности. Для людей религиозного восприятия и воспитания это часть пути, состояния, в которых раскрываются новые аспекты бытия, это просто нормально, как без этого. Лично я с первого дыхания стремился к мистицизму, верил, искал, находил, бросался в секты и тайные общества. Тебя же, насколько понимаю, в определенный момент выбросило в «непонятное», бытие просто поставило перед лицом странной данности. Типа что делать, если на тебя смотрят ангелы, и после того, как ты закроешь глаза и откроешь их снова, ангелы будут продолжать на тебя смотреть?! То, что нормально и правильно для человека мистическо-религиозного воспитания, людей другого восприятия может запросто свести с ума.
 
- Наверное, мои взгляды на тот момент стоило бы назвать не столько атеистическими, сколько агностическими. Реакция была двоякая. Во-первых, возмущение, поскольку больше всего в открывшемся было грязи и издевательства над людьми. Во-вторых, восхищение и надежда, когда в этой грязи вдруг появлялись проблески любви, красоты и разума. 
 
С ума я не сходил, хотя иногда и были "заносы", когда я начинал всерьез верить в ту или иную "теорию". Как правило, эти заносы выправлялись быстро, обычно за несколько часов. Более серьезными были периоды безнадеги. В такие периоды очень помогала мысль о том, что нужно продолжать бороться, потому что от этого, пусть и в небольшой степени, зависит то, в каком духовном мире будут жить сегодняшние дети. 
 

Collapse )


Паук С.В.

врус

Можно ли определить, сфабрикован вирус или нет?
Ответ: нет.

Ответ: да. Можно определить, что вирус - НЕ сфабрикован (обратное - нельзя). Что и было сделано.

1100 нуклеотидных замен - причем равномерно по всему геному - отличие от ближайшего хита в базе.

Никаким криспером ты таких замен не наделаешь, ни в какой лабе.



Reply

vida_louca

April 9 2020, 14:31:29

Check
Collapse

Track

А естественным путём такое может произойти? Что должно было случиться, чтобы замены нуклеотидов оказались более-менее равномерными? А какие обычно природные мутации случаются в вирусах?
Спасибо.

Reply

kuzia_aka_zmey

April 10 2020, 13:52:19

Check
Collapse

Track

Естественным путем может произойти все что угодно. Даже то что будет казаться актом творения.
Наоборот очень не всегда -- в искусственных условиях никогда не получится достичь нужной массы для отбора.

Reply

vida_louca

April 10 2020, 16:09:07

Check
Collapse

Track

Ну, да. У нас в распоряжении только лабораторный стол, а у Природы... - куда ни кинь взглядом. Образцов хватает.
Но всё-же "отпечатки пальцев" от вторжения извне должны оставаться. Наше локальное вторжение должно бы оставлять какие-то специфические следы. Или нет? Статистическое распределение событий после нашего вмешательства слишком широкое?

Reply

nezrim

April 13 2020, 11:51:34

Check
Collapse

Track


Зависит от исходников.

Если Вы НЕ располагаете исходником — для Вас всё будет казаться естественным, ага.

Reply

urease

April 13 2020, 12:34:08

Check
Collapse

Track

Откуда исходник то?

Reply

nezrim

April 13 2020, 12:46:09

Check
Collapse

Track


Так и я о том же. Вы видите 1000+ замен по отношению к тому, ЧЕМ РАСПОЛАГАЕТЕ (что знаете). И делаете вывод, что вирус вполне себе естественный, ибо ТАКУЮ работу ни одна лаборатория в мире провести технически не может.

Ну да — если только у этой лаборатории нет исходника, который Вам неизвестен. И где нужно не 1000+ замен осуществить, а, например, менее дюжины.

Reply

urease

April 13 2020, 14:08:54

Check
Collapse

Track

Я так и понял. Вопрос, а откуда у нехорошей лабы такой источник?

В целом, конечно, нет 100% уверенности ни в одном ответе.

Я предлагал экспертменты на лет мышах провести, заразить обратно.

Также: массовое сиквенирование этой живности из этих самых мышей и пвнголинов с сопутствующим забоем, чтобы два раза не вставать.

Reply

nezrim

April 13 2020, 14:23:28

Check
Collapse

Track


Я так и понял. Вопрос, а откуда у нехорошей лабы такой источник?

Откуда у нехороших людей то, чего нет у хороших? Вот оттуда же и.

Я предлагал экспертменты на лет мышах провести, заразить обратно.

Также: массовое сиквенирование этой живности из этих самых мышей и пвнголинов с сопутствующим забоем, чтобы два раза не вставать.

Очень разумно, своего рода интеллектуальный реверс-инжиниринг по точкам входа-выхода. И технически вполне осуществимо. Нужно, полезно, важно. И бюджетно.

Но, если этого всего никто не делает и не сделал до сих пор — что это может означать?..
Паук С.В.

(no subject)

Не помню точно кажется Фарадей мертвую лягушку электричеством оживлял и она дергалась Вот и наш так Зюганов решил провести форум с левым поворотом. А денег захочешь ещё не такое придумаешь
Паук С.В.

12 друзей

Дурацкая мысль, но вот мне чудится призрак капитализма и поиски справедливости в этим мире капитализма во всех этих 12 друзьях оушена и проч 100500 фильмов про ограбления
Деньги воруют парни у "жирных котов", такие робины гуды, - всем низам - нравится, а также владельцам охранных компаний - они ценники задирают жирным котам
Паук С.В.

Конец времен

Если у иудеев такой бардак пошел, - точно конец времен. Сына жалко, встрянет




Пишет Имян Отчествович Фамильев (nomen_nescio)
2019-12-09 09:19:00
Назад Избранное Поделиться Отслеживать Пожаловаться
Категории:
Животные
Религия
Поправленцы
В хабадском нью-эйдже для домохозяек пересказывают "Танию" своеобразно. Во-первых, убирают из неё слово "еврей", заменяя на "человек". С точки зрения всего Хабада, двести лет, до самых последних десятилетий это "ересь, святый владыко, сущая ересь". Вплоть до аккуратного вымарывания слова "еврей" из длинных цитат.
А во-вторых, интересную трансформацию претерпело учение о двух душах. Животная душа осталась как есть, а Б-жественная душа потеряла одно качество. Нигде не говорится о ненависти и отвращении к телу, которую душа испытывает по своей природе. А ведь это фундаментально. И кроме "Тании", других источников учения о двух душах нет! Где взяли... Причём пишут серьёзные такие просветители.
Паук С.В.

(no subject)

Теперь по существу. Я сейчас объясню, как вообще вычисляются такие вероятности. Вначале на примерах с внятными человеку числами, без миллионов.
Начнем с того, что сумма вероятностей всех возможных исходов случайного события равна 1. Т.е. вы встретите или не встретите динозавра обязательно. При бросании монеты обязательно выпадет орел или решка (испорченные монеты мы не рассматриваем, потому что тервер - раздел математики, а математика имеет дело с абстракциями).
Возьмем игральную кость, которая представляет собой куб, на каждой стороне которого имеется определенное число очков: от 1 до 6. Вероятность выпадения каждого числа - одна шестая. В сумме шесть шестых, т.е. единица (случай, когда кость зависла в воздухе, опять же не рассматириваем).
Теперь рассмотрим такую задачу: какова вероятность, что при десяти бросаниях кости шестерка выпадет хотя бы один раз?
Как это считаем. Вероятность неблагоприятного исхода (когда шестерка не выпадает) 1-1/6 т.е. 5/6. Словами: единица минус одна шестая, т.е. пять шестых.
Теперь считаем, какова вероятность неблагоприятного исхода при десяти бросаниях. Они независимы, поэтому количество бросаний - степень. (5/6)^10. Пять шестых в десятой степени. Это - вероятность того, что шестерка не выпадет ни разу при десяти бросаниях. Вероятность противоположного события: шестерка выпала хотя бы один раз при десяти бросаниях получается вычитанием из единицы. Т.е. 1-(5/6)^10.
Общая формула вероятность благоприятного события при определенном числе испытаний: 1-(1-n)^k где n - вероятность благоприятного события, k - число испытаний.
Можно так же посчитать и вероятность выпадения последовательности монет. Начнем с длины 3. Допустим, 101 или 111 - неважно. Испытание - бросание монеты три раза. Какова вероятность, что последовательность 111 выпадет хотя бы один раз при пяти испытаниях?
Вероятность выпадения любой последовательности длины 3 0.5^3 т.е. одна восьмая, т.е. 0.125.
Вероятность, что при одном испытании НЕ выпадет последовательность 111 равна 1-1/8 или 5/8 или 0.875.
Вероятность, что последовательность 111 НЕ выпадет при пяти испытаниях (5/8)^5 или 0.512908935546875.
Чтобы получить вероятность, что 111 выпадет хотя бы раз при пяти испытаниях, вычитаем это число из 1.
Получаем 0.487091064453125.
При увеличении числа испытаний мы повысили вероятность такого исхода с одной восьмой до почти одной второй.
И при увеличении числа испытаний вероятность будет расти. Но она никогда не станет равной единице. Расстояние между ней и единицей будет всё время уменьшаться, но никогда не дойдет до равенства, как Ахилл никогда не догонит черепаху.
Паук С.В.

(no subject)

https://medium.com/@sergey_57776/%D0%BA%D0%BE%D0%B4-%D1%80%D0%B0%D0%B7%D1%83%D0%BC%D0%B0-%D0%BF%D1%80%D0%B0%D0%B2%D0%B8%D0%BB%D0%B0-%D0%BF%D1%80%D0%BE%D1%88%D0%B8%D0%B2%D0%BA%D0%B8-%D0%BC%D0%BE%D0%B7%D0%B3%D0%B0-%D0%B7%D0%B0%D0%BA%D0%BE%D0%B4%D0%B8%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D1%8B-%D0%B2-%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%BE%D0%BC%D0%B5-%D0%BC%D0%B8%D0%BB%D0%BB%D0%B8%D0%BE%D0%BD%D0%B0%D0%BC%D0%B8-%D0%BB%D0%B5%D1%82-%D1%8D%D0%B2%D0%BE%D0%BB%D1%8E%D1%86%D0%B8%D0%B8-%D1%81-eb445ae3fa0e

) Хватит морочить себе голову, и пора признать следующее.
Современные исследования в области ИИ вообще не ведут к созданию разума, а лишь имитируют его отдельные возможности (бумажный голубь тоже парит, но он — вовсе не птица, не модель птицы и даже не этап к построению модели птицы).
Во многих отношениях ИИ далек от возможностей интеллекта детенышей собаки, мыши или даже паука, и не похоже, что простое расширение существующих подходов позволит хоть когда-то достичь этих целей (многие животные эффективно функционируют после 10⁶ и даже меньшего количество секунд жизни: белка может прыгать с дерева на дерево через несколько недель от рождения, жеребенок может ходить через несколько часов, а пауки рождаются готовыми к охоте).
Никакими из существующих методов машинного обучения эту проблему не решить в принципе (земные живые существа не имеют такого времени и объемов данных, что требуются даже при самых продвинутых и эффективных методах машинного обучения).
Разрыв между мышью и человеческим интеллектом намного меньше, чем между нынешним ИИ и мышью. Это значит, что даже если наша конечная цель — догнать (не то что перегнать) человеческий интеллект, разумной ближайшей целью для ИИ было бы достичь интеллекта мыши.


Например, послание может быть адресовано коллективному бессознательному, записано на языке гильбертовых пространств и отправлено с помощью феномена синхроничности (подробней здесь и здесь.
Паук С.В.

Дроздофили прилетели из космоса -3!

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0079610718300798

Yohn et al. (2005) заявили, что их данные согласуются с ретровирусной инфекцией, которая бомбардировала геномы шимпанзе и горилл независимо и одновременно, 3-4 миллиона лет назад, при этом не подразумевалась горизонтальная передача. Недавно Diehl et al. (2016) показали, что определенная эндогенная ретровирусная группа (ERV-Fc) каким-то образом распространилась по всему миру на многие виды млекопитающих около 33-15 миллионов лет назад. Имеются также предположения о том, что более позднее эволюционное развитие гоминид, включая усиление познавательной способности, также может иметь вирусное происхождение ( Villareal, 2004)). По-видимому, правдоподобное вирусное вмешательство, вызванное внешним воздействием, было выявлено в развитии плаценты млекопитающих у предков всех млекопитающих, включая людей около 150 миллионов лет назад ( Katzourakis (2013) ).

13 . Эволюция интеллектуальной сложности
Доказательства роли внеземных вирусов в влиянии на эволюцию земной среды в последнее время были правдоподобно намечены в секвенировании генов и транскриптомов цефалоподов. Геном Осьминога показывает ошеломляющий уровень сложности с 33 000 белок-кодирующих генов больше, чем в Homo sapiens ( Albertin et al., 2015 ). Осьминог принадлежит колеидному подклассу моллюсков (головоногих моллюсков), которые имеют эволюционную историю, которая простирается на более чем 500 миллионов лет, хотя филогенетика цефалоподов является весьма противоречивой и запутанной (см. Carlini et al., 2000 ; Strugnell et al., 2005 , 2006 , 2007 ; Bergmann et al., 2006). Головоногие также очень разнообразны, с поведенчески сложными рулеидами (кальмарами, каракатицами и осьминогами), предположительно возникающими под чистой земной эволюционной моделью из более примитивных наутилоидов. Однако генетическая дивергенция Осьминога из его предкового колеидного подкласса очень велика, сродни экстремальным особенностям, наблюдаемым во многих родах и видах, отмеченных в Eldridge-Gould пунктированных образцах равновесий (ниже). Его большой мозг и сложная нервная система, похожие на камеру глаза, гибкие тела, мгновенная камуфляж благодаря способности переключаться по цвету и форме - вот лишь некоторые из поразительных особенностей, которые внезапно появляются на эволюционной сцене. Трансформирующие гены, ведущие от консенсусного предка Наутилуса (например, Nautilus pompilius) к обычным каракатицам ( Sepia officinalis ) к кальмару ( Loligo vulgaris ) к общему осью ( Octopus vulgaris , рис.5 ), нелегко найти в любой ранее существовавшей форме жизни - возможно, тогда было бы предположить, что они кажутся быть заимствованным из далекого «будущего» в терминах земной эволюции или более реалистично из космоса в целом. Такое внеземное происхождение как объяснение возникновения, конечно, противоречит преобладающей доминирующей парадигме.

Рисунок 4
Загрузить изображение с высоким разрешением (212KB)Загрузить полноразмерное изображение
Рис . Типичные основные функции вирусов . Они соответствуют всем существенным аспектам роста собственного производства и более широкой сотовой техники. Изображение вируса от: https://www.dreamstime.com/royalty-free-stock-photo-h1n1-viruses-image11898035 .

Рисунок 5
Загрузить изображение с высоким разрешением (326 КБ)Загрузить полноразмерное изображение
Рис . Эволюция от кальмара до осьминогов совместима с набором генов, вставленных внеземными вирусами . Альтернативный внеземный сценарий, который скрывается, состоит в том, что популяция криоконсервированных эмбрионов осьминогов, выведенных из космоса, массово из космоса 275 миллионов лет назад.

Изображение Squid - Grimalditeuthis bonplandi. jpg.From Wikimedia Commons -Author: URL-адрес Jeanne Le Roux & L. Joubin ( http://www.archive.org/stream/rsultatsdescam17albe#page/n165/mode/2up )

Изображение Octopus - Файл: Octopus at Kelly Tarlton's.jpg Материал из Wikimedia Commons Автор: Pseudopanax at English Wikipedia

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/f/ff/Octopus_at_Kelly_Tarlton%27s.jpg

Изображение вируса от: https://www.dreamstime.com/royalty-free-stock-photo-h1n1-viruses-image11898035 .

Однако в соответствии с этим заключением находятся недавние РНК, редактирующие транскриптологические данные о механизмах диверсификации соматической РНК в поведенческих узорах Цефалоподов, таких как Осьминог. Эти данные демонстрируют обширный эволюционный консервативный аденозин в инозин (A-к-I) редактирование мРНКа сайты в почти каждом кодирующих белках гена в поведенческий сложных coleoid головоногих (Octopus в частности),но не в Nautilus(Liscovitch-Брауэрдр. , 2017). Это огромное качественное различие в редактировании белков, кодирующих цефалоподобный мРНК A-to-I, по сравнению с наутилусом и другими беспозвоночными и позвоночными животными поражает. Таким образом, на экранированных экранах только 1-3% Drosophilaи человеческие белки, кодирующие мРНК, содержат участок кодирования A-to-I; и там всего около 25 человеческих мРНК-сообщений, которые содержат консервативный участок перекодировки A-to-I через млекопитающих. В линиях дрозофилы имеется около 65 консервативных A-сайтов в кодирующих белок генах и только некоторые из них идентифицированы в C. elegans, которые подтверждают гипотезу о том, что перекодировка редактирования РНК A-to-I в основном является нейтральной, вредной или редко адаптивной (рассматривается в Liscovitch-Brauer et al., 2017 ). Тем не менее , в частности , кальмаров и Octopus является нормой, с ген , кодирующий почти каждый белок , имеющий эволюционно консервативны A-к-I редактирование сайта мРНК изоформы , что приводит к изменению кислотного несинонимичными аминокислоты ( Liscovitch-Brauer и др., 2017). Это виртуальный качественный скачок в молекулярно-генетической стратегии в предполагаемой гладкой и постепенной эволюционной линии - типе внезапного «большого скачка вперед». Если все новые гены, выраженные в линиях кальмара / осьминога, не возникли из простых мутаций существующих генов ни у кальмаров, ни у других организмов, разделяющих одну и ту же среду обитания, нет никакого способа, с помощью которого этот большой качественный переход в мРНК A-to-I редактирование может быть объяснено обычными нео-дарвиновскими процессами, даже если разрешен горизонтальный перенос генов . Одним из правдоподобных объяснений, на наш взгляд, является то, что новые гены, вероятно, являются новым внеземным импортом на Землю - наиболее правдоподобно, как уже когерентная группа действующих генов внутри (скажем) криоконсервированных и защищенных матрицами оплодотворенных яиц Octopus.

Таким образом, вероятность того, что криоконсервированные яйца кальмаров и / или осьминога, прибывшие в ледяные болиды несколько сотен миллионов лет назад, не должны быть снижены (ниже), поскольку это было бы экономным космическим объяснением внезапного появления Осьминога на Земле ca. 270 миллионов лет назад. Действительно, этот принцип применим к внезапному появлению в летописи окаменелостей довольно хорошо всех основных форм жизни, охваченных предвидящей концепцией «акцентированного равновесия» Элдриджа и Гулда, выдвинутых в начале 1970-х годов ( 1972 , 1977 ); и увидеть концептуальный мультфильм, изображенный на рис . Таким образом, подобные живые существа, подобные этому, «как если бы гены были получены из какого-то предсуществования» ( Hoyle and Wickramasinghe, 1981) применяются ко многим другим биологическим ансамблям при тщательном изучении. Одним из немногих известных, но убедительных примеров является отклик и устойчивость глазных структур плодовой мухи дрозофилы до нормального летального повреждения УФ-излучения при 2537 Å, учитывая, что эта длина волны не проникает в озоновый слой и, следовательно, не проявляется в качестве дарвиновского избирательного фактора ( Lutz and Grisewood, 1934 ) и см. Hoyle and Wickramasinghe (1981), с.12-13). Многие из этих «неземных» свойств организмов могут быть правдоподобно объяснены, если мы допустим увеличенную космическую биосферу, о которой свидетельствуют современные астрономические исследования - открытия уже обсуждавшихся экзопланет. Среднее расстояние между жилыми планетами в нашей галактике теперь должно считаться в светлые годы - обычно 5 световых лет ( Wickramasinghe et al., 2012 ). Таким образом, обмены Virion / gene оказываются неизбежными на таких коротких космических расстояниях. Многие особенности биологии, которые не оптимизированы для локальных условий на Земле, могут быть легко поняты в этой более широкой перспективе.

Рисунок 6
Загрузить изображение с высоким разрешением (426 КБ)Загрузить полноразмерное изображение
Рис . Концептуальный мультфильм - Космическая эволюция после осенних и наземных эволюционных отношений. Эволюционные закономерности для основного консервативного белка, такого как, например, гемоглобин ( перенос O 2 ) или цитохром C (перенос электронов). 10 различных вариантов белков от А до Я. Этот мультфильм иллюстрирует концептуальные различия для эволюционных схем, вызванных падением вида организма из космоса, за которым следует последующая земная эволюция (слева) по отношению к эволюционным отношениям между этими же группы консервативных белков после филогенетического деревазаставляют данные оценивать количественные оценки отношений гомологии на основе, например, Нейтральной теории Кимуры (синонимичной вариации третьей позиции). На левой стороне независимые линии инициируются в разное время на падении из космоса (из •). Справа «Дерево» формируется алгоритмом, который предполагает прямые эволюционные отношения предшественника для всех гомологичных вариантов консервативного белка. Разветвленные группы F, G и HJJ являются подлинными наземными эволюционными диверсификациями. A и B вымерли вскоре после падения. Адаптировано из концепций, изложенных в Hoyle and Wickramasinghe (1981) . Рис. 6.3 и 6.4 стр. 83-85. Существенное понятие слева соответствует пунктирной схеме равновесий Элдриджа и Гулда (1972) ,Гулд и Элдридж (1977) . Таким образом, обычная филогенетика любого типа действует на молчаливое предположение о том, что все гомологии связаны, возникая только на Земле, игнорируя вклад Космического эволюционного измерения в данные.

Учитывая, что комплексные множества новых генов в Octopus могут не состоять исключительно из горизонтальных переносов генов или простых случайных мутаций существующих генов или путем простого дублирования экспансий, тогда логично догадываться, учитывая наши текущие знания о биологии комет и их обломки, новые гены и их вирусные водители, скорее всего, пришли из космоса. Однако также ясно, что для принятия такого предложения также требуется, чтобы мы уменьшали роль сильно локализованной дарвиновской эволюции на Земле, которая, вероятно, будет сильно сопротивляться традиционным биологам. Разумеется, это не должно вызывать беспокойства, поскольку основное внимание нашего внимания к общим эволюционным молекулярным процессам теперь переходит в Космос и за пределы нашей непосредственной солнечной системы. Это доказательство обеспечивает и позволяет изучать КосмическиеGene Pools - и они способны управлять, и, смею сказать, контролировать и, следовательно, управлять биологической эволюцией здесь на Земле (через дарвиновские и не дарвиновские механизмы адаптации). Основным эффектом земной дарвиновской эволюции является действие на эти новые гены, полученные из космоса, и их тонкая настройка с помощью последующих соматических и зародышевых линий обратной связи с ламаркинским геном и механизмов перетасовки гаплотипов в соответствии с окружающей средой, а также организма реципиента (Wickramasinghe and Steele, 2016). Действительно, было показано, что вирусные следы проявляются в ткани мозга человека, которые, по-видимому, отмечают важные шаги, которые привели к нынешнему состоянию человека (Villarreal, 2004;Ryan, 2009).

14 . Эволюционное происхождение ретровирусов позвоночных
Это теперь приводит нас к основному и важному уроку домашнего урока этого обзора. Хотя все вирусы, если смотреть внимательно, чрезвычайно умны, Retroviruses (семейство Retroviridiae ) находятся там с самыми сложными и компактными из всех известных вирусов. Эти вирусы и их элементы (ферменты обратной транскриптазы, связанные с индуцированными мобильными ретроэлементами) теперь, по-видимому, являются важными v iral-драйверами основных эволюционных генетических изменений на Земле за последние несколько сотен миллионов лет ( Wickramasinghe, 2012 ) и см. ( Hoyle and Wickramasinghe, 1979 , 1981 ). Склеточная обратная транскриптаза(RT) также является основным молекулярным игроком в адаптивной соматической гипермутации генов антител ( Franklin et al., 2004 ; Steele, 2016b , Steele and Lindley, 2017 ). Как уже обсуждалось, эндогенные ретровирусные векторы, а также активности RT, вероятно, будут задействованы в трансплантатах Ламаркиана сомы и зародышевой линии в иммунной системе ( Steele, 1979 ; Steele et al., 1984 ; Steele et al., 1998 ; Steele and Lloyd , 2015 ; Стила, 2016a ) , включая формирование, дублирующее расширение и адаптивную перетасовку блок-родовое гаплотипаструктуры генома человека и более высокого млекопитающего ( Dawkins et al., 1999 ; McLure et al., 2013 ; Steele, 2014 , 2015 ; Dawkins, 2015 ).

Основная генетическая и эволюционная особенность РНК-ретровируса заключается в том, что при продуктивной инфекции вирус обеспечивает копирование ДНК с двойной цепью (ds) вирусного одноцепочечного (ss) РНК-генома и что он интегрирован как провирус в хост клеточного генома ( Темин, 1974 ). Когда активен этот потенциально скрытый провирус, он транскрибируется и продуцирует вирусное потомство в зараженной клетке для экспорта в другие клетки. Если клетка-хозяин является клеткой зародышевой линии, то интегрированный провирус может передаваться вертикально в организм потомства.

Ретровирусы могут инфицировать широкий спектр животных клеток, и полученные комплексные провирусы могут оставить свой след в качестве «геномных окаменелостей», называемых эндогенными ретровирусами (ERV). Таким образом, эти последовательности ДНК являются реликтами прошлых и, вероятно, вирулентных эпидемий, связанных с ВИЧ, в результате которых выжившие, а теперь частично иммунные к немедленному варианту ВИЧ-инфекции, имеют геномную интеграцию в своих клетках зародышевой линии (приводя, как обсуждалось, к дублирующее расширение и диверсификация функциональных блоков преднового гаплотипа ( Dawkins et al., 1999 ; Dawkins, 2015 ).

Эти области ретровирусных исследований теперь расцветают с большим количеством данных в публичных базах данных. В настоящее время обнаружено много древних ERV, позволяющих исследовать раннюю эволюционную историю ретровирусов с помощью биоинформационных методов. До недавнего времени оценки самого старого возраста из анализа ретровирусов и ERV млекопитающих были непосредственно выведены в далекое прошлое около 100 миллионов лет, к началу излучения млекопитающих. Теперь ясно, что в комплексном коэволюционном филогенетическом анализе ( Aiewsakun and Katzourakis, 2017 ), что эндогенные ретровирусы костной рыбы демонстрируют схему совместного видообразования со своими хозяевами (еще не столь ясными для эндометрических ретровирусов амфибий). Однако общая модель совместного соизмеренияERV с известными временами появления их видов-хозяев позвонков очень убедительны. Другие возможные древние вирусные перекрестные виды и трансмиссии классов проходили с низкой скоростью (с участием рыбий рыбок, акул и лягушек), однако в анализе выявлены две основные линии рисковых рыбных ERV: одна линия из них получила два новых аксессуара генов в их гораздо больших геномах (~ 20 Кб, или вдвое больше, чем у существующих ретровирусов млекопитающих). Таким образом, эта крупная ретровирусная линия (и ретровирусы в целом) имеет древнее морское происхождение, которое «... возникло вместе с, если не раньше, своими челюстными хозяевами позвоночных> 450 миллионов лет назад в ордовикский период, ранняя палеозойская эра» ( Айвсакун и Катзуракис, 2017 год). Это очень важный результат, и авторы заключают: «... наши анализы дают доказательства, как филогенетически, так и временно, что ретровирусы возникли вместе с их хозяевами позвоночных в океане, ~ 460-550 мА, в раннюю палеозойскую эру, если не раньше ».

Это, конечно, относится к этим сложным векторам вирусных генов - и их связанным с генам эффектам эволюционных драйверов - до или до кембрийского взрыва. Безусловно, они появляются перед более поздним эволюционным появлением гораздо более сложных видов животных и растений, существующих на Земле. Другими словами, теперь мы можем сделать правдоподобный научный аргумент о том, что ключевая особенность информационно-плотных генетических систем для создания более сложных организмов уже была на Земле до фактического возникновения последующей большей наземной сложности. Это противоречие, если мы рассмотрим только что рассмотренную точку зрения, что все вирусы, и в частности ретровирусы, являются «отражением в микромире генетического регулятивного состава хозяина», т. Е.Фиг.4 ).